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  • Title:  Population genetic structure and phylogeoraphic patterns in the chinese endemic species Sagittaria lichuanensis,inferred from cpDNA atpB-rbcL intergenic spacers
  • Authors: 
  • Corresponding Author:  Fan Liu,ShuYing Zhao, Wei Li, JinMing Chen,QingFeng Wang*
  • Pubyear:  2010
  • Title of Journal:  Botany
  • Paper Code: 
  • Volume:  88
  • Number:  10
  • Page:  886-892
  • Others: 
  • Classification: 
  • Source: 

    Abstract:

  • Both historical (e.g., glaciations) and spatial (geological features) factors are considered to have had significant influences on the distribution and genetic structure of many plants. To understand the effects of such factors on the current genetic and geographical distributions of plant species in the Nanling and central regions in China, we examined genetic variation and phylogeographical patterns of Sagittaria lichuanensis J.K. Chen (Alismataceae), an endangered and endemic species in China, using chloroplast DNA atpB-rbcL intergenic spacer sequence variation. In this study, a total of 9 haplotypes from 47 individuals in 6 populations of S. lichuanensis were detected. The NST (0.193) was significantly higher than GST (0.082) (P< 0.05), indicating a significant phylogeographical structure. In the minimum spanning network (MSN) of the haplotypes, the distribution of haplotypes showed an east-west split. The results of the Mantel test analysis showed that there was no correlation between the genetic distance and geographical distance (r = 0.539, P> 0.05). The formation of barriers to dispersal might have played an important role in shaping the population genetic structure of S. lichuanensis. Within each region (east and west regions), high levels of gene flow between populations and low levels of population differentiation were found. Several conditions, such as co-ancestry due to recent common ancestry or short period of isolation, might have occurred among the populations studied. In the MSN, all tip haplotypes except for two (A and G) occurred in two or more populations, and the haplotype D in the interior node was widespread. The haplotype D is likely to be an ancestral haplotype and represents the relic, widely distributed haplotype before the populations were fragmented and isolated by mountain uplift.

    On considère que les facteurs historiques (ex. glaciations) et spatiaux (caractères géologiques) exercent des influences significatives sur la distribution ainsi que la structure génétique de nombreuses plantes. Afin de comprendre les effets de tels facteurs sur la génétique actuelle et les distributions géographiques d'espèces végétales de la région de Nanling et du centre de la Chine, les auteurs ont examiné la variation génétique et les patrons phylogéographiques du Sagittaria lichuanensis J.K. Chen (Alismataceae), une espèce endémique menacée de la Chine, en utilisant la variation des séquences de l'espaceur intergénique atpB-rbcL de l'ADN chloroplastique. Dans cette étude, ils ont détecté un total de 9 haplotypes provenant de 47 individus issus de 6 populations du S.lichuanensis. Le NST (0,193) étant significativement plus grand que le GST (0,082) (P< 0,05) indique une structure phylogéographique robuste. Dans le réseau d'étalement minimum (MSN) des haplotypes, la distribution des haplotypes montre une fracture est-ouest. Les résultats d'analyse du test de Mantel montrent l'absence de corrélation entre la distance génétique et la distance géographique (r = 0,539, P> 0,05). La formation de barrières à la dispersion pourrait avoir joué un r?le important pour fa?onner la structure de la population génétique du S.lichuanensis. Pour chaque région (régions est et ouest), on observe de forts flux de gènes entre les populations et de faibles degrés de différenciations des populations. Il est possible que plusieurs conditions comme la co-descendance commune due à des ancêtres communs récents ou de courtes périodes d'isolation soient survenues au sein des populations étudiées. Dans le MSN, on observe tous les haplotypes de pointe sauf deux haplotypes (A et G) dans deux ou plusieurs populations et l'haplotype D du noeud intérieur est largement répandu. Il est probable que l'haplotype D soit un haplotype ancestral et représente un haplotype vestigial largement distribué avant la fragmentation des populations et l'isolation par l'émergence des montagnes.
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